Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pkp2Q9CQ73 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkp2Q9CQ73 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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