Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nudcd2Q9CQ48 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms