Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms