Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ms4a4dQ99N05 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms