Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd1Q99MV1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms