Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TrabdQ99JY4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrabdQ99JY4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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