Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lims1Q99JW4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lims1Q99JW4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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