Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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