Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms