Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfdQ925I7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PdgfdQ925I7 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PdgfdQ925I7 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PdgfdQ925I7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfdQ925I7 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms