Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sf3b5Q923D4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sf3b5Q923D4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sf3b5Q923D4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sf3b5Q923D4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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