Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Slc6a20aQ8VDB9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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