Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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