Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RfxapQ8VCG9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.88
RfxapQ8VCG9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
RfxapQ8VCG9 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
RfxapQ8VCG9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RfxapQ8VCG9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RfxapQ8VCG9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RfxapQ8VCG9 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RfxapQ8VCG9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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