Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cops8Q8VBV7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cops8Q8VBV7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops8Q8VBV7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops8Q8VBV7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops8Q8VBV7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops8Q8VBV7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cops8Q8VBV7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms