Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Abcf3Q8K268 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Abcf3Q8K268 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Abcf3Q8K268 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Abcf3Q8K268 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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