Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrit1Q8K099 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrit1Q8K099 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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