Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Snx8Q8CFD4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms