Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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