Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms