Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms