Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm29367-201ENSMUST00000190911 1327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trim35Q8C006 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim35Q8C006 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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