Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ctdsp2Q8BX07 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ctdsp2Q8BX07 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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