Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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