Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx17Q8BVL3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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