Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4bQ8BGE6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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