Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
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