Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kcnf1Q7TSH7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnf1Q7TSH7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnf1Q7TSH7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Kcnf1Q7TSH7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kcnf1Q7TSH7 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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