Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Actn1Q7TPR4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms