Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrc2bQ7TPM1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms