Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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