Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmeff1Q6PFE7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmeff1Q6PFE7 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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