Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp49Q6P9L4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp49Q6P9L4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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