Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CltbQ6IRU5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms