Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Krt40Q6IFX3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms