Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf4Q64287 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms