Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifit1Q64282 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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