Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tfe3Q64092 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfe3Q64092 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms