Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ecm1Q61508 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ecm1Q61508 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ecm1Q61508 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms