Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BcanQ61361 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BcanQ61361 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms