Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TmpoQ61033 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms