Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms