Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbbp7Q60973 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp7Q60973 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms