Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.8 ms