Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tbc1d1Q60949 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tbc1d1Q60949 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms