Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnfsf15Q5UBV8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms