Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms