Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms