Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms