Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms